Duplicazione (Double Agent)
Sydney e Vaughn costringono il capo della sicurezza di Markovic a rivelare dove si trova Lennox. Sydney interrompe la tortura di Lennox e stordisce i due uomini che lo interrogavano. Gli occhi di Lennox erano sottoposti a qualcosa, così Sydney benda l'uomo e lo porta via con sé mentre Vaughn scarica i file su Helix. Quando Sydney viene attaccata da una guardia, Lennox rimuove le sue bende, rischiando la sua vista, e spara alla guardia.
A Los Angeles, Lennox torna in salute. Sottoposto ad interrogatorio, Lennox spiega che, mentre lui ed Emma Wallace stavano lavorando per Markovic come esperti di sicurezza, avevano scoperto che l'uomo stava lavorando per qualcun'altro. Lennox stava per accedere al database a Cayo per trasmettere i dati alla Wallace a Berlino, ma è stato catturato prima di poterlo fare. Sydney è turbata quando viene a sapere che Lennox e la Wallace stavano insieme.
La scansione oculare di Lennox prova che lui non è un duplicato, e l'uomo è sconvolto quando Sydney gli dice che è stato duplicato. La CIA scopre che Markovic ha portato Helix in Polonia. Sydney e Lennox devono trovarlo, scaricarne i dati e distruggere le macchine.
Vaughn informa Sydney della telefonata. Jack le dice di disarmare ambedue gli uomini, e sarà la CIA a scoprire come stanno le cose una volta che i due uomini saranno entrambi sotto custodia. Sydney fa ammanettare Lennox nel laboratorio, poi va via, ma Lennox si rompe la mano per liberarsi dalle manette e prende una pistola.
Sydney affronta il secondo Lennox, ma appare anche il primo Lennox. Sydney minaccia di far esplodere Helix, allora il secondo Lennox reagisce alla notizia e cerca di sparare a Sydney. Il primo, e vero, Lennox spara ed uccide il suo duplicato. Sydney distrugge allora Helix.
Alla CIA, Lennox si prepara ad andare alle isole Fiji: non è mai stato lì, e lui ed Emma ci sarebbero andati in luna di miele.
Più tardi, nell'appartamento di Sydney, lei e Vaughn vanno a letto insieme, ma non sanno di essere osservati tramite una telecamera segretamente installata nella televisione da Francie, l'altro duplicato creato tramite Helix.
A Los Angeles, Lennox torna in salute. Sottoposto ad interrogatorio, Lennox spiega che, mentre lui ed Emma Wallace stavano lavorando per Markovic come esperti di sicurezza, avevano scoperto che l'uomo stava lavorando per qualcun'altro. Lennox stava per accedere al database a Cayo per trasmettere i dati alla Wallace a Berlino, ma è stato catturato prima di poterlo fare. Sydney è turbata quando viene a sapere che Lennox e la Wallace stavano insieme.
La scansione oculare di Lennox prova che lui non è un duplicato, e l'uomo è sconvolto quando Sydney gli dice che è stato duplicato. La CIA scopre che Markovic ha portato Helix in Polonia. Sydney e Lennox devono trovarlo, scaricarne i dati e distruggere le macchine.
Vaughn informa Sydney della telefonata. Jack le dice di disarmare ambedue gli uomini, e sarà la CIA a scoprire come stanno le cose una volta che i due uomini saranno entrambi sotto custodia. Sydney fa ammanettare Lennox nel laboratorio, poi va via, ma Lennox si rompe la mano per liberarsi dalle manette e prende una pistola.
Sydney affronta il secondo Lennox, ma appare anche il primo Lennox. Sydney minaccia di far esplodere Helix, allora il secondo Lennox reagisce alla notizia e cerca di sparare a Sydney. Il primo, e vero, Lennox spara ed uccide il suo duplicato. Sydney distrugge allora Helix.
Alla CIA, Lennox si prepara ad andare alle isole Fiji: non è mai stato lì, e lui ed Emma ci sarebbero andati in luna di miele.
Più tardi, nell'appartamento di Sydney, lei e Vaughn vanno a letto insieme, ma non sanno di essere osservati tramite una telecamera segretamente installata nella televisione da Francie, l'altro duplicato creato tramite Helix.